Communications
Suivez les activités du pôle, des centres de données et services, des consortiums d'expertise scientifique ainsi que les dernières actualités de l'IR Data Terra. Demandez à recevoir les prochains numéros par mail en suivant ce lien d'inscription.
Présentation du pôle ODATIS sur des événements extérieurs
Les membres du pôle ODATIS sont régulièrement amenés à présenter leurs activités lors de colloques, ateliers ou tables rondes. Retrouvez les présentations du pôle pour chacun de ces événements.
Le pôle ODATIS publie un rapport d'activités annuel, qui synthétise les activités et les actions menées durant l'année passée à l'échelle du pôle, de ses Centres de Données et Services et au travers de son implication dans différents projets nationaux et européens et dans les instances de l'IR Data Terra.
Assemblée Générale : ODATIS organise une assemblée générale sur une fréquence d'environ tous les 18 mois, avec une 1ère édition en décembre 2023. En juin 2026, cette Assemblée Générale est prolongée pour célébrer les 10 ans du pôle ODATIS. Les rencontres sont interdisciplinaires avec l’objectif d’échanger, de trouver des ponts entre nos disciplines marines, les IRs et les grands programmes afin de mieux cibler, fédérer et coordonner la réponse aux besoins en termes en gestions de données et de produits de la communauté océanographique. Retrouvez le programme et les supports de présentations de l'Assemblée Générale 2023 et de l'Assemblée Générale 2025.
Plusieurs webinaires présentent le pôle ODATIS: organisation du pôle ODATIS au sein de l'IR Data Terra, fonctionnement et objectifs, actions et activités du pôle. Les supports sont accessibles en ligne.
Diapos de présentation du pôle : Douze diapos réalisées en 2024, offre une présentation synthétique du pôle Océan ODATIS, avec un support texte pour décrire chaque diapositive : présentation de l'infrastructure de recherche Data Terra et du pôle ODATIS : gouvernance, thématiques, les Centres de Données et Services, les Consortiums d'Expertise Scientifique, le catalogue de données, l'offre de services, les projets dans lesquels le pôle est impliqué, l'animation de cette grande communauté des données de la recherche en océnaographie ainsi que tous les liens pour nous suivre ou nous contacter ...
Ce poster présente au format A0, les objectifs et l'organisation du pôle, les fonctionnalités du catalogue de données ainsi que ses offres de services pour les producteurs de données dans l'implémentation des principes FAIR et des entrepôts de données.
Cette fiche synthétique présente au format A4, a été réalisée par l'Infrastructure de Recherche Data Terra selon le même modèle pour chacun des 4 pôles thématiques : disciplines, provenance des données, type de services, présentation, principaux exemples de produits, principaux projets en cours, catalogue.
Présentations du pôle à des événements extérieurs
Atelier TT-CYTO
Un atelier EuroMarine TT-CYTO "Tips and Tricks towards flow cytometry data FAIRness" est organisé par MIO, SYKE, CEFAS, LOG, SZN et HCMR, au LOG à Wimereux du 4 au 6 juin 2024. Cet atelier vise à construire des jeux de données interopérables pour la cytométrie en flux. Il réunit les utilisateurs de cytomètres en flux in situ pour les amener à classer de la même manière les groupes de phytoplancton à partir de fichiers bruts. Il s'agit d'une étape obligatoire pour construire l'interopérabilité, les meilleures pratiques de gestion des données et des initiatives communes pour les jeux de données ouvertes.
Le Consortium d'Expertise Scientifique Cytométrie en flux du pôle ODATIS participe en tant qu'expert à cet atelier.
Les participants intéressés peuvent poser leur candidature en contactant Melilotus Thyssen avant le 29 février 2024.
Plus d'information ci-dessous, dans l'annonce en anglais.
Organised by MIO, SYKE, CEFAS, LOG, SZN and HCMR, the EuroMarine workshop TT-CYTO aimed to build interoperable data sets for flow cytometry will be held at the LOG in Wimereux early June 2024. It will gather together users of in situ flow cytometers to make them classifying on the same way the phytoplankton groups from raw files. This is a mandatory step to build interoperability, data management best practices and push together initiatives for open datasets.
The CES-CYTOMETRIE ODATIS will participate as experts in the workshop.
Description: Marine high frequency in-situ flow cytometry allows the analysis of phytoplankton at the single cell level, providing huge data sets of abundances and optical properties related to pigment content and size proxy. The TT-CYTO workshop aims to enhance marine flow cytometry data accessibility and reliability, focusing on FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) principles. It addresses discrepancies in manual gating and emphasizes establishing common guidelines, leveraging automated neural network processes, and promoting accessible databases. The initiative seeks to standardise practices and enhances the role of flow cytometry as a core variable in ecosystem monitoring. The TT-CYTO workshop is also an opportunity to tighten the actual in situ flow cytometry community even though most of us collaborate already together in national or international initiatives. However, the EuroMarine workshop is the unique occasion to be together for 3 days, to share our knowledge and train early career scientists to face new challenges such as using artificial intelligence methodology for analysing data on phytoplankton diversity and contribute to the development of more accurate ocean models.
Interested participants can apply by contacting Melilotus Thyssen before the 29 of February 2024.
Where: Laboratory of Oceanology and Geosciences (LOG) - Wimereux (northern France) with remote access of the workshop (partially).
When: 4th, 5th and 6th of June 2024
Organisers: Melilotus Thyssen (MIO-CNRS), Lumi Haraguchi (SYKE), Constantin Frangoulis (HCMR), Raffaella Casotti (SNZ), Veronique Creach (Cefas), Felipe Artigas (LOG-CNRS-ULCO)
Sponsors: EuroMarine (European Marine Research Network), JERICO-S3 (Grant agreement ID 871153, project coordinator: IFREMER), OBAMA-NEXT (Grant agreement ID: 101081642, project coordinator: AARHUS UNIVERSITET), IFSea graduate school (France 2030 grant – ANR-21-EXES-0011), PPR RioMAR (France 2030 grant - ANR-22-POCE-0006_RIOMar).
