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Nouveau : Catalogue de Ressources ODATIS

Le catalogue de ressources du Pôle ODATIS regroupe les logiciels, codes, outils, applications, supports, formations et autre ressources proposés par la communauté scientifique.

Pourquoi un catalogue de ressources ?

Constat

De nombreux produits de recherche (logiciels, codes, outils, applications, supports, services …) se sont développés au sein des laboratoires. Bien que ces productions soient essentielles aux travaux des scientifiques, elles restent souvent peu visibles pour la communauté. 

Afin d’en améliorer la découvrabilité, de les valoriser et de stimuler la collaboration inter-laboratoires, il est indispensable de les documenter et de les publier dans un espace dédié. 

En rendant chaque code, chaque outil ou chaque service accessibles, chaque équipe peut s’appuyer sur des réalisations existantes, ce qui permet de favoriser le travail collectif. Connaître les productions déjà réalisé permet d’enrichir les solutions déjà déployées et de construire, ensemble, des ressources plus robustes et plus utiles.

Cette démarche contribue ainsi à la réutilisation, à la reproductibilité des résultats et à la mise en place d’une véritable communauté d’échange autour des produits de recherche.

Jusqu’à présent, les services de bancarisation et de découverte proposés référencent principalement les jeux de données. Pour intégrer complètement les autres types de productions dans ces services, il devient indispensable de leur attribuer un Identifiant Unique Persistant (DOI, SWHID …).

Cette nécessité répond à deux exigences majeures : 

  • Exigences des éditeurs scientifiques : Les revues et comités de rédaction demandent aujourd’hui une citabilité fiable des outils et logiciels utilisés dans les publications. Un identifiant stable permet aux auteurs d’attribuer correctement le crédit aux développeurs et aux utilisateurs de retrouver facilement la version exacte utilisée.
  • Impératifs du mouvement de la science ouverte : L’ouverture des logiciels fait désormais partie intégrante des politiques nationales et européennes :

Ces cadres législatifs et stratégiques étendent les principes FAIR aux codes et logiciels, tout comme le font les jeux de données.

En attribuant systématiquement des identifiants uniques à toutes les productions de recherche, un écosystème de référence est créé, où chaque ressource est aisément repérable, citée et réutilisable, au bénéfice de la reproduction scientifique et la collaboration inter-laboratoires.

Solutions

Pour répondre à ces enjeux, le pôle ODATIS, en partenariat avec l’équipe de l’entrepôt Sextant, a mis en place un nouveau type de fiches de métadonnées permettant de décrire les ressources.

Dans ce contexte, le terme ressource désigne toutes les productions et services scientifiques qui ne sont ni des jeux de données (et leurs services d’accès), ni des publications ou documents (qui bénéficient déjà de leurs propres circuits de diffusion).

Ces fiches servent exclusivement à décrire la ressource : elles rassemblent les informations essentielles (titre, auteurs, version, identifiant persistant, licence, domaine d’application …) et pointent vers l’emplacement où la ressource est réellement conservée. Elles ne stockent pas le code, le logiciel ou l’application lui-même.

« Où sont stockées les ressources ? » 

Pour les logiciels, scripts et bibliothèques, des entrepôts dédiés tel que Software Heritage sont recommandés. 

Un exemple de fiche (Exemple de fiche de métadonnées) illustre concrètement la structure et montre comment un identifiant persistant (DOI, SWHID) est intégré et comment le lien vers le dépôt code est présenté.

Les ressources incluent notamment :

Les logiciels

Ce sont toutes les productions reposant sur du code source accessible et réutilisable : codes, notebooks, bibliothèques, outils en ligne ou logiciels complets permettant d’exploiter, visualiser, transformer ou analyser des données.

Les applications

Ce sont des interfaces en ligne prêtes à l’emploi, accessibles via un navigateur et conçues pour un usage direct : visualiseurs cartographiques, tableaux de bord, plateformes thématiques …

Les supports de formation

Ce sont des ressources destinées à transmettre des savoir-faire : tutoriels pas-à-pas, vidéos, guides PDF, notebooks pédagogiques, supports de formation … L’objectif est de faciliter l’appropriation d’un outil, d’un jeu de données, d’un traitement ou d’une méthode.

Les supports et assistance

Ce sont des moyens (pas uniquement numériques) mis à disposition pour accompagner les travaux scientifiques : infrastructures de calcul, plateformes techniques, services spécialisés, équipes d’experts, accompagnements personnalisés …

Intérêts pour la communauté scientifique

Pour les déposants 

Déposer une ressource dans le catalogue ODATIS permet de :

  • Valoriser un travail souvent peu visible (codes, outils, services, supports)
  • Le rendre découvrable par l’ensemble de la communauté scientifique
  • Obtenir un DOI, facilitant la citation de la ressource dans les publications
  • Améliorer les aspects FAIR des logiciels et des codes
  • Favoriser la réutilisation, la mutualisation et de nouvelles collaborations

Pour les projets ou structures disposant déjà d’un catalogue Sextant, ce dispositif permet désormais de décentraliser également les logiciels et codes développés, et pas uniquement les jeux de données.

Pour les utilisateurs Le catalogue de ressources offre un point d’entrée unique pour découvrir : 

  • Des outils
  • Des applications
  • Des supports de formation
  • Des services et moyens d’accompagnement

Tous sont mis à disposition de la communauté scientifique.

Les ressources sont organisées selon différents critères (type de ressource, cycle de vie de la donnée, langage de développement, variables essentielles), ce qui facilite l’identification d’outils directement utiles aux travaux de recherche.

Pour créer des fiches de ressources dans le catalogue ODATIS, deux options sont possibles :

  • Création de manière autonome (après une prise en main rapide) directement sur Sextant. Pour cela, écrire à contact@odatis-ocean.fr
  • Renseigner le formulaire accessible via ce lien (préconisé dans le cas d’une demande ponctuelle)

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