Atelier GFM - sept 2025

Thématiques des groupes de discussion

1. LIMS et aspects réglementaires
2. Traçabilité de l'acquisition à la diffusion
3. Acquisition des échantillons en mer
4. Gestion des données issues des échantillons en Biologie
5. Gestion des données issues des échantillons en Géologie
6. Gestion des données issues des échantillons en Chimie

Programme

08h30 - Accueil des participants
08h45 - Mise en place des trois premiers groupes de discussion
10h00 - Pause-café
10h10 - Reprise des discussions
11h30 - Élaboration de la synthèse des discussions
11h45 - Restitution devant l’assemblée
12h30 - Déjeuner
13h15 - Mise en place des trois seconds groupes de discussion
15h00 - Pause-café
15h10 - Élaboration de la synthèse des discussions
15h25 - Restitution devant l’assemblée
16h10 - Fin de la journée

Les systèmes de gestion informatisée de laboratoire (LIMS) prennent une place de plus en plus centrale dans la recherche scientifique, en particulier lorsqu’il s’agit de gérer des données et des échantillons. Ils constituent aujourd’hui l’un des outils les plus pertinents pour garantir une traçabilité complète, depuis la collecte des échantillons jusqu’à la diffusion des données, tout en assurant la transparence et la fiabilité nécessaires aux projets scientifiques.

La traçabilité, depuis l’acquisition des échantillons jusqu’à la diffusion des données, est également un élément central pour garantir à la fois la qualité scientifique et la conformité réglementaire. Dans le contexte de l’exploration et de l’étude des grands fonds marins, il est essentiel de s’assurer que la recherche, la production et l’utilisation des échantillons respectent pleinement les cadres légaux et environnementaux, tels que les accords sur l’accès et le partage des avantages (APA) ou encore les discussions en cours autour du traité BBNJ.

Toutefois, l’un des principaux défis liés à l’utilisation des LIMS réside dans la cohérence et l’interopérabilité des systèmes employés. Chaque institut ou laboratoire a tendance à utiliser son propre outil, ce qui génère une fragmentation et complique la circulation, la comparaison et l’intégration des données. Cette situation freine le partage et la mise en valeur des informations.

L’introduction de cette thématique invite donc à réfléchir aux possibilités d’harmonisation et, à terme, d’homogénéisation des solutions LIMS. Une telle démarche représenterait une avancée considérable dans la gestion des données, en renforçant leur interopérabilité et leur pérennité, et en facilitant les synergies entre communautés scientifiques.

La traçabilité, depuis l’acquisition des échantillons jusqu’à la diffusion des données, est un élément central pour garantir à la fois la qualité scientifique et la conformité réglementaire.

Au-delà de ces aspects réglementaires, la traçabilité constitue un levier fondamental pour répondre aux critères FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable et Réutilisable). Elle permet de renforcer la solidité, la fiabilité et la pérennité des données, afin de garantir leur réutilisation dans d’autres contextes scientifiques et interdisciplinaires.

Cette thématique met ainsi en avant l’importance de développer des pratiques standardisées et robustes, capables d’assurer une continuité entre la collecte sur le terrain, le stockage, le traitement et la diffusion des données. La réflexion autour d’un identifiant unique pour chaque échantillon constitue une des meilleures solutions. Elle faciliterait le suivi tout au long du cycle de vie de l’échantillon et renforcerait l’interopérabilité entre bases de données et institutions.

Ce groupe thématique a pour objectif de rassembler des chercheurs et ingénieurs travaillant sur les échantillons biologiques collectés en grands fonds, mais appartenant à des laboratoires et instituts différents. Il vise à créer un espace d’échange autour des bonnes pratiques existantes, tout comme des difficultés rencontrées dans la gestion des données associées. L’ambition est de favoriser une meilleure cohérence et d’identifier collectivement des pistes d’amélioration pour renforcer la valeur scientifique des données biologiques.

L’objectif de ce groupe thématique est de permettre la rencontre et le dialogue entre spécialistes de la géologie marine impliqués dans l’étude et la gestion des échantillons issus des grands fonds. En partageant leurs expériences, les participants pourront confronter leurs méthodes, mettre en lumière les bonnes pratiques déjà mises en place, mais aussi pointer les blocages ou difficultés persistantes. Cet échange vise à identifier des solutions concrètes pour améliorer la gestion et la valorisation des données géologiques.

Ce groupe thématique réunit les acteurs travaillant sur les échantillons et données chimiques liés aux grands fonds marins. L’objectif est de favoriser les échanges entre équipes de différentes institutions afin de partager expériences et pratiques, qu’elles soient positives ou au contraire marquées par des obstacles récurrents. En confrontant ces retours d’expérience, les participants pourront dégager des recommandations communes et ouvrir la voie à une gestion plus harmonisée et efficace des données chimiques.