Technical workshop - September 2020
Atelier Technique #7 : Gestion de données biologiques marines
ORGANISATION : Joël SUDRE (LEGOS/UMR5566), Cécile NYS (IFREMER IRSI/SISMER).
DATE : mardi 22 septembre (9h-18h) et mercredi 23 septembre (9h-16h30) 2020.
LIEU : Visioconférence GoToMeeting / Salle de visioconférence du bâtiment Jules Barrois à l’IMEV (ex-OOV).
Suite à votre inscription, les informations de connexion ont été transmises par mail.
- Présentation du Pôle de données Océan – ODATIS – Gilbert MAUDIRE
- Présentations des initiatives dans la gestion des données biologiques marines (20min/présentation + 10min de questions) :
- PNDB, de la gestion de données à son analyse, présentation des outils et services– Yvan LE BRAS
- EMBRC (France) Données biologiques marines dans le Centre National de Ressources Biologiques Marines - Gemma GIMENEZ-PAPIOL - présentation accessible exclusivement à destination des participants pendant l'atelier.
- SAR/SIMM : référentiels utilisés dans le cadre du Système d'Information sur le Milieu Marin – Clémence RABEVOLO
- ECOTAXA & Zooplancton - Jean-Olivier IRISSON - présentation accessible sur authentification; veuillez renseigner vos identifiants dans la marge en haut à droite de cette page pour voir apparaître le titre et le lien de cette présentation à la suite de cette liste à puces.
- SeaDataCloud/EMODNet Bio/PhytOBS : Mise en place des chaines de traitement à Roscoff pour la publication des données des suivis à long terme– Mark HOEBEKE
- SNO BENTHOBS - Vincent BOUCHET / Nicolas DESROY
- Quadrige - Arnaud ROUILLY
- APA & SI MORSE - Le projet MORSE, vers un nouveau portail de suivi des échantillons biologiques - Sylvie VAN ISEGHEM
- Imagerie - Catherine BORREMANS
- Cytométrie - Gérald GREGORI, Felipe ARTIGAS, Maurice LIBES, Marc Sourisseau, Melilotus Thyssen
- Qu'est-ce que la cytométrie en flux (diapos 1-10),
- Cytométrie en flux automatisée et accessibilité des données pico-nano-microplancton (diapos 11-30),
- Avancement chaîne de traitement de cytométrie en flux (diapos 31-45).
- Ateliers de discussions :
- Atelier de discussion « Référentiels »
- Atelier de discussion « Format de données »
- Atelier de discussion « Outils »
- Atelier de discussion « Imagerie »
- Autres points & Préparation du prochain Atelier Technique
Compte-rendu de l'Atelier technique ODATIS de septembre 2020, à télécharger en pdf ou à visualiser ci-dessous, dans l'onglet "Compte-rendu".
Artigas Felipe (CNRS/ULCO)
Borremans Catherine (IFREMER, Environnement Profond)
Carval Thierry (IFREMER)
Cattaneo Raffaela (CNRS - EMBRC - IMEV)
Chauvel Cédric (IUEM)
Conquet Florence (IFREMER)
Coppola Laurent (Sorbonne Université / IMEV)
Del Amo Yolanda (OASU)
Desroy Nicolas (IFREMER)
Detoc Jérôme (IFREMER)
Fichaut Michele (IFREMER)
Gimenez-Papiol Gemma (EMBRC - IMEV)
Gregori Gérald (MIO)
Harscoat Valérie (IFREMER)
Hennebaut Brendan (IFREMER)
Hoebeke Mark (Sorbonne Université / CNRS)
Irisson Jean-Olivier (Sorbonne Université / IMEV)
Lebourg Laurence (IUEM)
Le Bras Yvan (MNHN, PNDB)
Libes Maurice (MIO)
Maudire Gilbert (IFREMER)
Mendes Fabrice (CNRS/EPOC)
Mercier Caroline
Nys Cécile (IFREMER)
Pamerlon Sophie (GBIF)
Rabévolo Clémence (IFREMER, SIMM)
Rodriguez Kévin (IFREMER)
Rouilly Arnaud (IFREMER, Quadrige)
Rouyer Armelle (IFREMER, SIMM)
Sauzède Raphaëlle (CNRS/IMEV)
Schmechtig Catherine (Sorbonne Université / CNRS)
Schmidt Sabine (Univ. Bordeaux, OASU - EPOC)
Sourisseau Marc (IFREMER)
Sudre Joel (UMS CPST/CNRS)
Uitz Julia (IMEV)
Van Iseghem Sylvie (IFREMER)
